L’architettura gestionale ed operativa di IAL Nazionale Srl Impresa sociale è improntata ad un approccio lavorativo di tipo orizzontale, in cui ogni area collabora con le altre secondo una logica circolare. 

Con il Presidente si interfacciano direttamente il Coordinamento della Rete IAL e l’Ufficio del personale.

Al Presidente e agli altri membri del CdA fanno riferimento i Quadri dell'Area Programmazione e Sviluppo, ciascuno per la sua sfera di competenza, nonché la Segreteria organizzativa, l'Area Comunicazione e l'Area Informatica.

Con il Consiglio di Amministrazione si relazionano altresì i componenti del Comitato Tecnico Scientifico, l’Organismo di Vigilanza, il Collegio dei Sindaci.

La nuova struttura organizzativa di IAL Nazionale consta principalmente di tre macro-aree: Programmazione e Sviluppo, Formazione e Ricerca, Amministrazione, affiancate da funzioni trasversali riferite alla Segreteria organizzativa, all'Area Informatica e all'Area Comunicazione.